Schrödinger PyMOL for Mac 是一款专业的分子可视化与建模软件,广泛应用于结构生物学、药物设计及化学研究。提供高清3D分子渲染、动态模拟及结构分析功能,支持蛋白质、核酸等生物大分子的可视化操作。Mac版经深度优化,运行流畅,兼容macOS系统,是科研人员与教育工作者的理想工具。
Schrödinger PyMOL安装教程
拖动安装
安装完成后双击打开破解补丁,
拖动左边的文件到右边的文件夹中进行替换
bin路径:/Applications/PyMOL.app/Contents/bin pymol路径:/Applications/PyMOL.app/Contents/lib/python3.10/site-packages/pymol
然后将pymol.lic拖到桌面上待用
打开软件,选择Browse for License File
选择拖到桌面的pymol.lic,点击Open
Schrödinger PyMOL功能特色
1. 专业级分子可视化
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提供高清 3D 分子渲染,支持蛋白质、核酸、小分子等复杂结构的可视化
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多种显示模式(卡通、棍状、球棍、表面等),满足不同研究需求
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支持 Ray-Tracing 光线追踪,可生成出版级高质量图片
2. 强大的结构分析工具
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测量工具:精确计算 键长、键角、二面角 等结构参数
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结构比对:自动/手动 分子叠合(Alignment),分析结构差异
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电子密度图支持:可加载 X-ray衍射数据,验证模型准确性
3. 分子动力学与构象分析
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集成 Maestro 计算引擎,支持分子动力学轨迹可视化
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构象变化动画制作,模拟蛋白质折叠/构象变化过程
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氢键网络分析、静电势表面计算等高级功能
4. 药物设计辅助功能
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配体-受体相互作用分析(氢键、疏水作用、π-π堆积等)
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结合口袋探测与可视化,辅助 虚拟筛选 和 分子对接
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支持 药效团模型(Pharmacophore) 的构建与应用
5. 科研协作与数据管理
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兼容 PDB、SDF、MOL2 等标准格式,无缝对接主流数据库
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支持 Python 脚本扩展,可自动化处理复杂任务
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项目文件可保存为 Session 格式,保留所有分析状态
6. 教育演示功能
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一键生成 高质量动画(MP4/GIF),用于学术报告
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幻灯片模式:创建分步讲解的分子演示文稿
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交互式教学工具,适合课堂分子结构展示
7. 深度优化的Mac体验
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原生支持 Apple Silicon(M1/M2),性能大幅提升
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完美适配 macOS 图形渲染管线,流畅操作大型分子体系
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支持 Retina 显示屏,呈现更锐利的分子细节
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